Madrasah Tsanawiyah Assakinah (MTs) adalah salah satu unit dari Madrasah Assakinah yang berdiri pada tahun 2009. Madrasah Tsanawiyah merupakan jenjang Pendidikan di Indonesia yang setara dengan Sekolah Menengah Pertama, pengelolaannya dilakukan oleh Kementerian Agama. Sistem pembelajaran di MTs Assakinah bertujuan untuk mewujudkan santri yang berakhlakul karimah, berprestasi dan berilmu serta menumbuhkan produktivitas dan integritas dalam komitmen organisasi berlandaskan nilai – nilai teladan akhlak Rasulullah SAW Shiddiq, Amanah, Tabligh dan Fathonah (SATF).
Dilengkapi dengan sarana dan prasarana yang memadai serta tenaga pendidik yang kompeten dan berpengalaman, MTs Assakinah berhasil meraih akreditasi A.
Misi
Melatih dan membiasakan peserta didik terampil dalam ujian, berbahasa dan membaca Al - Qur’an
Melengkapi administrasi madrasah demi pelayanan maksimal
Melaksanakan proses pembelajaran yang efektif dan efisien
Melaksanakan penilaian secara tuntas
Meningkatkan kualitas pendidik dan tenaga kependidikan
Memanfaatkan sarana dan prasarana yang menunjang penyelenggaraan pendidikan berbasis IT dan berwawasan lingkungan
Menyelenggarakan tata kelola madrasah yang efektif, efisien, akuntabel dan amanah untuk mencapai visi, misi dan tujuan madrasah
Mendanai seluruh keperluan peserta didik di unit dan mencatat pemasukan dan pengeluaran keuangan